حضرت مستطاب آيت الله حاج سيد جعفر مرقاتي خويي يکي از علماي مشهور تهران به شمار مي رفت. فقيد سعيد در سال 1348ق ( 1308ش) در شهر خوي در بيت علم و فضيلت به دنيا آمد.
پدر بزرگوارش مرحوم آيت الله حاج سيد هاشم موسوي خويي ( م 1358ق ) از شاگردان شيخ الشريعه اصفهاني و نويسنده مفتاح الکلام في شرح شرايع الاسلام و اربعين حديث بود ( معارف الرجال ، ج 3،ص 265.)آن مرحوم پس از دوران کودکي و آموختن قرآن در 1360 ق ( 1321ش ) به مدرسه علميه نمازي وارد شد و تحصيل علوم ديني را آغاز کرد و تا شرح لمعه را فرا گرفت. در 1324 ش به حوزه علميه قم آمد و سطوح عاليه را نزد حضرات آيات مجاهدي تبريزي، کمالوند خرم آبادي، مرعشي نجفي ، سلطاني طباطبايي و علامه طباطبايي بياموخت و پس از آن به دروس آيات عظام بروجردي، حجت کوهکمري ، امام خميني و محقق داماد حاضر شد و مباني علمي اش را استوار ساخت و بيشترين بهره ها را از آيت الله حاج سيد محمد حجت کوهکمري برد، پس از وفات ايشان ( 1373 ق ) راهي نجف اشرف شد و در درس هاي آيات عظام حکيم، خويي و سيد عبدالهادي شيرازي حاضر شد و به درجه اجتهاد نائل آمد. سپس به امر آيت الله خويي به زادگاهش بازگشت و به تبليغ دين ، تأليف و تدريس و اقامه جماعت پرداخت و در سال 1360 ش به تهران آمد و کار خويش را ادامه داد. از آثار اوست ( که متأسفانه هيچ کدام به چاپ نرسيده است ):
شرح الاسماء الحسني (15 ج)؛ خصائص النبي و اوهام حولها؛ ابحاث حول الاحاديث و سندها الي امير المؤمنين في صحيح البخاري ؛ شرح حال سيد هاشم مرقاتي خويي و علماي معاصر ايشان در خوي و تبريز؛ شرح حال علماي خوي ؛ کتاب البيع - تقرير درس آيت الله حجت ؛ تقريرات درس اصول آيت الله خويي ؛ تقريرات درس اصول آيت الله داماد ( اصول عمليه )؛ الامر بين الامرين - تقرير درس اصول امام خميني ؛ ديوان شعر.
منبع: آينه ي پژوهش 92 /س